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改正感染症法に基づく医療措置協定を締結した医療機関（病院、診療所、薬局及び訪問看護事業所）に対し、施設・設備整備費の補助を行うものです。令和６年度から実施しています。
各協定締結医療機関の感染症対応力強化のための施設整備等の補助を行います。
令和7年度予算：1,378,133千円
一類感染症患者受入時の感染防御体制を強化する取り組みに補助を行います。
令和7年度予算：26,466千円
感染症指定医療機関の整備に要する経費を補助します。
令和7年度予算：1,000千円
この事業は、医療機関におけるサイバーセキュリティ対策に係る経費を支援することにより、医療機関のデジタル化を促進し、安定的な医療提供体制を確保していくことを目的としています。
令和7年度予算：332,813千円
妊婦の多様なニーズに応え、身近な地域で安全・安心に出産できる環境を整備するため、医療機器や情報通信機器等の設備整備を促進する取り組みに補助を行います。
令和7年度予算：4,000千円
医療機関自身での転院搬送手段の確保を支援します。
令和7年度予算：489,672千円
かかりつけ医等によるオンライン医療相談、オンライン受診勧奨及びオンライン診療（以下「オンライン医療相談・診療等」という。）を推進するため、医療機関が実施する環境整備を支援します。
令和7年度予算：6,000千円
通信技術を応用した遠隔医療を実施することにより、医療の地域格差を解消し、医療の質及び信頼性を確保することを目的としています。
遠隔病理診断、遠隔画像診断、遠隔手術指導、オンライン診療のいずれかを実施するのに必要なコンピューター機器等の購入に要する設備整備費の一部を補助します。（国庫補助事業）
令和7年度予算：13,164千円
ＮＢＣ災害発生時における傷病者への医療の確保及び、医療救護の体系的な整備への取り組みに補助を行います。
令和7年度予算：118千円
