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水素、アンモニア、LNG、メタノール及び電力（バッテリー）を推進エネルギー源とする船舶（以下「ゼロエミッション船等」）の建造において、水素、アンモニア及び電力（バッテリー）を推進エネルギー源とさせるために必要となるエンジン、燃料タンク、燃料供給システム等（関連舶用機器等）の生産設備の整備事業、及びこれらの関連舶用機器等を船舶に搭載（艤装）するための艤装プラットフォーム等の整備事業（間接補助事業）を実施することにより、ゼロエミッション船等の国内生産体制を世界に先駆けて構築し、市場導入促進によるCO2の排出削減を進めるとともに産業競争力強化・経済成長を図ることを目的とする。
今回の公募の補助対象となる推進エネルギー源は、水素、アンモニア及び電力（バッテリー）となる。

予算額は150億円（初年度：10億円）。
なお、４月１７日に公募締切した令和7年度（補正予算）一次公募の事業の採択後に、二次公募の事業を採択する予定。