はい、直近の決算期で給与や役員報酬の支払いがない場合でも申請は可能です。
ただし、基準年度には申請企業から直接給与を支給される従業員がいる必要がございます。
なお、補助事業１人当たり給与支給総額の算定にあたり含める補助事業に関わる従業員は、基準年度及びその算定対象となる各事業年度において、全月分の給与等の支給を受けた従業員とします。

基準年度の1人当たり給与支給総額を特定するのが困難な場合や、補助事業の効果を会社全体の賃上げにつなげる場合は、事業者全体の従業員数および1人当たり給与支給総額を用いることができます。